החל משנת הלימודים הקרובה יתחיל מעבר הדרגתי של מגמות מדעי המחשב מהוראת שפות התכנות הוותיקות פסקל ו-C לשפות Java ו- C#. בשנות הלימודים תשס"ז ותשס"ח יוכלו המורים ללמד את שפות התכנות הישנות או את השפות החדשות כרצונם. משנת תשס"ט יותיר משה"ח ללמד רק את שפות המחשב החדשות ובחינות הבגרות ביחידות החובה במדעי המחשב ייערכו בשפות אלו. דברים אלה מסר המפקח על מדעי המחשב במשרד החינוך, ד"ר אבי כהן, ביום עיון בנושא "מדעי המחשב לאן", שנערך לאחרונה במכון דוידסון, שבמכון ויצמן למדע ברחובות.
המפמ"ר הוסיף, כי מגמת מדעי המחשב בישראל היא הראשונה בעולם שתעבור לשפות החדשות ועל כך זכתה לתשבחות רבות של בכירי מדע וטכנולוגיה בעולם.
לדברי מנהלת מרכז המורים הארצי למדעי המחשב, ד"ר תמי לפידות, תוכנית הלימודים הישראלית במדעי המחשב היא מהמתקדמות בעולם. התוכנית פותחה על ידי ועדה בראשות פרופ' עמירם יהודאי.