עמותת נטר מפעילה בשנים האחרונות תוכנית דו-שנתית ללימודי מחשבים בפנימיות ובבתי"ס שבהם מרוכזים עולים חדשים, נוער מנותק ותלמידי החינוך המיוחד בכיתות י'-י"א. במסגרת התוכנית לומדים התלמידים להשתמש בתוכנות מיקרוסופט ומתנסים בעבודה מעשית בסביבה טכנולוגית מתקדמת. הלימודים בתוכנית מתקיימים בשני מסלולים; פיתוח תוכנה וניהול מערכות מחשב. בעת הצורך גם נערכת לתלמידים מכינה לתוכנית שבה הם לומדים אנגלית טכנית, ועורכים היכרות בסיסית עם עולם המחשוב. את הקורסים מעבירים מרצים של מכללת הי-טק וחברת ווי (WE). חלק ניכר מפעילות העמותה הוא על בסיס התנדבותי וללא תשלום, למשל, הקמת מעבדות מחשוב באמצעות תרומות של כספים, ציוד, ומדריכים מחברות היי-טק. בין בתיה"ס שבהן כבר פועלת העמותה; כפר הנוער יוהנה ז' בוטינסקי והכפר הירוק. בנוסף נפתחו גם כיתות לימוד בכפר הנוער ויצ"ו הדסים, בתיכון עירוני י"ב ביפו, בתיכון עירוני ט' בדרום תל אביב ובתיכון עירוני י"א, שבו מרוכזים תלמידים שנפלטו מבתי"ס אחרים בתל אביב. העלות של הקורסים הדו-שנתיים שהעמותה מעבירה בתשלום היא 1,200 דולר לתלמיד.